تشمل هذه المـادة دراسـة بعض الكائنـات الدقيقة ذات الأهميـة الصناعية وطرق تحسينها وراثيا، ومن ثم يتم التطرق لمفهوم التنقية الحيوية، وكيف تطور علم الأحياء الدقيقة الصناعية ليصبح بمفهومـه الواسع اليوم خصوصا فيما يتعلق بإنتاج المواد الثانويـة، مثل الحوامض العضويـة والمضادات الحيوية والفيتامينات والهرمونات والأنزيمـات، وكذلك السموم الفطريـة، كذلك يتم ربط إعـادة استعمال النفايات العضوية مع نشاطات الكائنـات الدقيقـة ومقدرتها على تحسين البيئـة من ناحيـة صحيـة.